Die Lexus Designsprache wurde in Form einer 20-Meter-Yacht neu interpretiert: Der sportlich-elegante LY 650 Flybridge-Cruiser behält die lebendige Form und die schönen geschwungenen Linien der Lexus Sport Yacht Konzeptstudie bei. Der ausgeprägte Bug und der dynamische Rumpf, der zu den breitesten seiner Klasse gehört, unterstreichen die Präsenz der LY 650, während das coupé-artige Dach und die akzentuierten Achterhüften die hohe Reisetauglichkeit betonen. Die optionale Zweifarblackierung unterstreicht die einzigartige Form und erinnert an die Lexus Sport Yacht Konzeptstudie von 2017. Metallische Akzente am Bug, an den Seitenfenstern und an den L-förmigen Lufteinlässen schaffen das ikonische Bild einer Lexus Yacht.
Das Interieur verbindet fortschrittliches Design und Omotenashi (japanisch für Gastfreundschaft), um die für Lexus typische hohe Qualität sicherzustellen. Der helle, vorwiegend in Weiß gehaltene Innenraum wirkt offen, während geschwungene Linien und kreative Beleuchtung ein angenehmes Gefühl der Geborgenheit vermitteln. Der Salon umfasst einen Kapitänssitz und vorwärts gerichtete Sofas sowie eine achtern (hinten) angeordnete Kombüse. Unterhalb des Salons befinden sich drei elegante Schlafzimmer mit einer Stehhöhe von mehr als zwei Metern, die jeweils über eine eigene Dusche verfügen.